Для морских свинок обоняние служит средством взаимной идентификации, прежде всего в сфере половых отношений. Именно обоняние даёт им информацию о готовности особи противоположного пола к спариванию.

Так, в моче самца содержится секрет, говорящий о его готовности к половому акту. Получив посредством обоняния этот сигнал, самка, не находящаяся в состоянии течки, в свою очередь выделает секрет, говорящий о невозможности совокупления в данный момент.

Всё социальное поведение морских свинок определяется той информацией, которую они получают посредством обоняния. Оно, в значительной степени, заменяет им зрение.

С помощью обоняния морские свинки распознают съедобные предметы и узнают своих хозяев.

Как и большинство животных, морские свинки метят мочой, содержащей специальный секрет, свою территорию, вне которой они чувствуют себя неуверенно и дискомфортно.

Иногда владелец морской свинки не может объяснить причину тревожного поведения своего питомца потому, что оно спровоцировано каким-либо новым или раздражающим животное запахом, не воспринимаемым человеком.

Ведь обоняние морских свинок развито примерно в тысячу раз сильнее, чем у людей.